El organismo defensor de los derechos universitarios fue creado en la casa de Hidalgo el 15 de junio de 2011 mediante el acuerdo administrativo número 5, siendo su reglamento aprobado por el H. Consejo Universitario el 19 de junio de 2012. A partir de ese momento surgió a la vida institucional la Defensoría de los Derechos Humanos Universitarios, que de conformidad con su reglamento es un órgano que se crea y opera teniendo como premisa fundamental el respeto a los principios de equidad y género, con carácter independiente, con plena libertad de acción respecto de cualquier autoridad universitaria para el ejercicio y cumplimiento de sus atribuciones.